Softwares


Principais programas utilizados em pesquisa científica pelo grupo:

 

GAMESS - (ab initio, DFT, semi-empirico, mecanica molecular, dinâmica molecular)

GAUSSIAN - (ab initio, DFT, semi-empirico, mecanica molecular)

FIREFLY - (ab initio, DFT, semi-empirico)

ORCA - (ab initio, DFT, semi-empírico)

NWCHEM - (ab initio, DFT, DFT plane wave, Carr-Parrinello MD, semi-empirico, mecanica molecular, dinâmica molecular)

GROMACS - (mecanica molecular, dinâmica molecular)

AVOGADRO - (visualização, mecanica molecular)

CHEM3D - (visualização, mecanica molecular)

 


Programas desenvolvidos no grupo:

 

SNAPY:  programa em Python, para automação na geração de inputs e leitura de outputs do GAMESS, para uso em calculos de solvatação com o modelo SMD, incluindo todos os 179 solventes.

(clique para baixar)

 

Ao utilizar o programa, por favor cite:

Dalessandro, E. V.; Pliego Jr, J. R., Fast Screening of Solvents for Simultaneous Extraction of Furfural, 5-Hydroxymethylfurfural and Levulinic acid from Aqueous Solution Using SMD Solvation Free Energies. J. Brazil. Chem. Soc. 2017.

 


Keywords para os solventes do modelo SMD no GAMESS:

 

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