Principais programas utilizados em pesquisa científica pelo grupo:
GAMESS - (ab initio, DFT, semi-empirico, mecanica molecular, dinâmica molecular)
FIREFLY - (ab initio, DFT, semi-empirico)
ORCA - (ab initio, DFT, semi-empírico)
GROMACS - (mecanica molecular, dinâmica molecular)
AVOGADRO - (visualização, mecanica molecular)
CHEM3D - (visualização, mecanica molecular)
Programas desenvolvidos no grupo:
SNAPY: programa em Python, para automação na geração de inputs e leitura de outputs do GAMESS, para uso em calculos de solvatação com o modelo SMD, incluindo todos os 179 solventes.
Ao utilizar o programa, por favor cite:
Dalessandro, E. V.; Pliego Jr, J. R., Fast Screening of Solvents for Simultaneous Extraction of Furfural, 5-Hydroxymethylfurfural and Levulinic acid from Aqueous Solution Using SMD Solvation Free Energies. J. Brazil. Chem. Soc. 2017.
Keywords para os solventes do modelo SMD no GAMESS:
Última atualização: 17/01/2024