Laboratório de Recursos Genéticos (LARGE)

O Laboratório de Recursos Genético realiza atividades de ensino, extensão, pesquisa e desenvolvimento em:

•  Genética de populações
•  Isolamento de marcadores moleculares microssatélites inéditos em peixes de piracema
• Uso de Sequenciamento de DNA de Nova Geração (NGS)
• Análise de códigos de barra de DNA
• Manutenção do Banco de DNA da ictiofauna do alto rio Grande
• Desenvolvimento de modelos e técnicas em  bioinformática.
• Análise de paternidade e parentesco animal.
• Caracterização de marcadores epidemiológicos.

>>Clique aqui para acessar o Banco de DNA da UFSJ<<

Código de barras do DNA (DNA barcodes)

Figura: Exemplo da determinação do código de barras do DNA de peixes do Banco de DNA da UFSJ

NGS

O sequeciamento de nova geração (NGS) é um termo guarda-chuva para várias técnicas de alto rendimento (massivamente paralelizadas) de obtenção de sequências de DNA e RNA. Em menos de 15 anos, o preço médio de grandes projetos de obtenção do genoma completo de organismos caiu de cerca de U$ 2.700,00 por milhão de bases sequenciadas (Mb) para menos de U$ 0,10 por Mb.

Sequenciamento de DNA de Nova Geração (NGS) - Plataforma Illumina HiSeq 2000 na montagem do genoma mitocondrial completo da piapara (Leporinus piavussu, Valenciennes, 1837, revisado em Britski et al. 2012):

>CLIQUE NA FIGURA PARA EXPANDIR<

Figura: O primeiro genoma mitocondrial completo de qualquer peixe anostomídeo (Leporinus piavussu  Britski et al., 2012) é obra da UFSJ e dos colaboradores do Labroatório de Rercursos Genéticos.

Figura: Exemplar de Leporinus piavussu (piapara) do Banco de DNA, utilizado para o sequenciamento de nova-geração (NGS).

Desenvolvimento de marcadores microssatélites heterólogos e de novo:

Figura: Exemplar de Brycon orbignyanus (piracanjuba) do Banco de DNA da UFSJ

Figura: PAGE exibindo resultados de amplificações heterólogas de loci de microssatélites de Brycon hilarii (piraputanga, descritos em Sanches e Galetti, 2006) em Brycon orbignyanus (piracanjuba).

Figura: PAGE exibindo resultados de amplificações dos primeiros loci de microssatélites espécie-específicos, isolados por meio de NGS, pelo Laboratório de Recursos Genéticos (Clique aqui) para Brycon orbignyanus (piracanjuba).

Figura: PAGE com exemplo de testes de marcadores para o dourado (Samlminus brasiliensis). Os resultados finais, 47 marcadores inéditos, foram publicados em Cao et al., 2016.

Apoio: CNPq, CEMIG-ANEEL, FAPEMIG, PROEX-UFSJ, PROAE-UFSJ e PROEN-UFSJ.

Última atualização: 28/07/2020