Laboratório de Recursos Genéticos (LARGE)
From the DNA spiral to the astounding landscape
NEW: An upstream trip across the fractal branches of the Tree of Life from Minas Gerais' rivers...
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/jfb.70278
...our modest contribution to Science.
O Laboratório de Recursos Genético realiza atividades de ensino, extensão, pesquisa e desenvolvimento em:
Código de barras do DNA (DNA barcodes)
Figura: Exemplo da determinação do código de barras do DNA de peixes do Banco de DNA da UFSJ
NGS
O sequeciamento de nova geração (NGS) é um termo guarda-chuva para várias técnicas de alto rendimento (massivamente paralelizadas) de obtenção de sequências de DNA e RNA. Em menos de 15 anos, o preço médio de grandes projetos de obtenção do genoma completo de organismos caiu de cerca de U$ 2.700,00 por milhão de bases sequenciadas (Mb) para menos de U$ 0,10 por Mb.
Sequenciamento de DNA de Nova Geração (NGS) - Plataforma Illumina HiSeq 2000 na montagem do genoma mitocondrial completo da piapara (Leporinus piavussu, Valenciennes, 1837, revisado em Britski et al. 2012):
Figura: O primeiro genoma mitocondrial completo de qualquer peixe anostomídeo (Leporinus piavussu Britski et al., 2012) é obra da UFSJ e dos colaboradores do Labroatório de Rercursos Genéticos.
Figura: PAGE exibindo resultados de amplificações dos primeiros loci de microssatélites espécie-específicos, isolados por meio de NGS, pelo Laboratório de Recursos Genéticos (Clique aqui) para Brycon orbignyanus (piracanjuba).
Figura: PAGE com exemplo de testes de marcadores para o dourado (Samlminus brasiliensis). Os resultados finais, 47 marcadores inéditos, foram publicados em Cao et al., 2016.
Novidade: Genoma completo (escala em megabases de DNA - Mpb = 1 milhão de pares de base) do peixe dourado, Salminus brasiliensis, da bacia do alto Paraná, uma possível espécie críptica (clique na figura para acessar os dados).
Galeria (em construção):
1) Conteúdo CG (faixa interna) e densidade de genes (faixa externa):
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2) Disposição de ilhotas CG (faixa única), possíveis alvos de regulação epigenética, de acordo com tamanho do número de repetições (Curtas <16 pb = Verde; < Média = Amarelo e; Longas >50 pb = Vermelho; N=180 observações) :
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3) Disposição da densidade (por janelas de 100 kpb) de das demais classes de microssatélites de períodos binários (dinucleotídeos), ranqueadas por frequência de observações (da faixa mais interna às mais externas), ao longo do genoma do dourado:
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4) Disposição da densidade (por janelas de 100 kpb) de microssatélites de períodos entre tri- e hexanucleotídeos):
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5) Disposição da densidade (por janelas de 100 kpb) de microssatélites mononucleotídeos à decanucleotíos, ranqueados por frequência de observação no genoma (da faixa mais interna às mais externas):
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6) Disposição de Elementos Transponíveis de Repetição Invertidas Miniatura (MITEs), ligados internamente por famílias diferentes (cores alternativas):
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7) Densidade de heterozigosidade entre homólgos (Hap1 x Hap2) em janelas de 1 Mb:
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Apoio: CNPq, CEMIG-ANEEL, FAPEMIG, PROEX-UFSJ, PROAE-UFSJ e PROEN-UFSJ.
Última atualização: 14/05/2026
